Грб Србије Грб Војводине Традиционални грб Војводине
У циљу ефикаснијег и рационанијег обављања делатности у Заводу се организују следећи Центри:

  1. Центар за промоцију здравља, анализу, планирање, организацију здравствене заштите, информатику и биостатистику у здравству
  2. Центар за превенцију и контролу болести
  3. Центар за хигијену и хуману екологију
  4. Центар за микробиологију
  5. Служба за правне, економско-финансијске, техничке и друге сличне послове

У оквиру организационих целина формирани су одсеци и одељења:

I Центар за промоцију здравља, анализу, планирање, организацију здравствене заштите, информатику и биостатистику у здравству

  1. Одсек за промоцију здравља и здравствено васпитање
  2. Одсек за анализу, планирање и организацију здравствене заштите
  3. Одсек за информатику и биостатистику у здравству

II Центар за превенцију и контролу болести

  1. Одсек за имунизацију и антирабичну заштиту
  2. Одсек за незаразне болести и здравствени надзор
  3. Одсек за заразне болести и ДДД послове

III Центар за хигијену и и хуману екологију

  1. Одељење хигијене
  2. Одељење санитарне хемије и екотоксикологије
    1. Одсек за испитивања ваздуха
    2. Одсек за испитивање воде, хране и предмета опште употребе
    3. Одсек за инструменталну аналитику

IV Центар за микробиологију

  1. Одељење клиничке микробиологије
  2. Одељење санитарне микробиологије

V Служба за правне, економско-финансијске, техничке и друге сличне послове

  1. Одељење за правне, опште и техничке послове
  2. Одељење за економске и рачуноводствене послове